2019年,在一次科學(xué)會(huì )議上的偶然邂逅使得密歇根州立大學(xué)(MSU)的研究人員識別出了第一個(gè)在高分辨率下實(shí)驗確定的蛋白質(zhì)結構,這一結構該結構有助于蛋白質(zhì)在輻射、高溫甚至太空真空等惡劣條件下生存。
在2019年,Ben Orlando教授在自然科學(xué)學(xué)院發(fā)表了一場(chǎng)研究演講,為數十年來(lái)醞釀的合作突破奠定了基礎。在那天的演講廳里,名譽(yù)教授Lee Kroos也在場(chǎng),他剛剛從MSU退休,經(jīng)歷了超過(guò)30年的開(kāi)創(chuàng )性職業(yè)生涯。
Kroos與斯巴達的團隊長(cháng)期以來(lái)一直在努力捕獲一種被稱(chēng)為SpoIVFB的蛋白質(zhì)結構(發(fā)音為“spo-four-eff-bee”)。SpoIVFB屬于一類(lèi)特殊的酶,這些酶有助于調節生命各個(gè)領(lǐng)域的關(guān)鍵細胞功能。
SpoIVFB在孢子形成過(guò)程中扮演著(zhù)重要角色,這一過(guò)程使得細菌能夠抵御極端環(huán)境。
由于多年試圖捕獲SpoIVFB結構的挑戰,Kroos對Orlando在前沿冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)領(lǐng)域的專(zhuān)長(cháng)產(chǎn)生了濃厚的興趣。
圖片信息:SpoIVFB的三維結構與黑白二維冷凍電鏡圖像。通過(guò)從不同角度拍攝數千張甚至數百萬(wàn)張樣本圖像,研究人員能夠繪制出非常詳細的3D地圖。
“冷凍電鏡讓我們得以觀(guān)察到一個(gè)通過(guò)其他方式無(wú)法看到的世界,”Orlando說(shuō)道。
現在,Orlando和Kroos的研究團隊在《自然通訊》期刊上發(fā)表的研究成果報告了SpoIVFB的第一個(gè)高分辨率實(shí)驗確定結構。
具體來(lái)說(shuō),研究人員發(fā)現了SpoIVFB與其相互作用的特定分子結合的情況,從而促進(jìn)了有用生化產(chǎn)物的生成。
這項研究深入了解了從細菌到人類(lèi)等生物體中發(fā)現的細胞調節機制,在微生物學(xué)、結構生物學(xué)和酶學(xué)等領(lǐng)域具有廣泛的應用前景。
“近年來(lái),這項技術(shù)在膜蛋白結構生物學(xué)中帶來(lái)了變革,”Orlando說(shuō)。這些發(fā)現為結構生物學(xué)提供了關(guān)鍵知識。
通過(guò)拍攝成千上萬(wàn)甚至數百萬(wàn)張樣本從不同角度的樣本圖像,研究人員能夠創(chuàng )建一個(gè)高度詳細的3D樣本地圖。
“這項技術(shù)幫助我們克服了許多挑戰,隨著(zhù)技術(shù)的不斷進(jìn)步,我們將深入探索生物學(xué)的更多新領(lǐng)域,”Orlando說(shuō),他期待MSU冷凍電子顯微鏡設施的擴展將為材料科學(xué)、微生物學(xué)和生物化學(xué)等多個(gè)學(xué)科的研究者帶來(lái)新的機遇。
雜志:Nature Communications
DOI:10.1038/s41467-024-52634-6