一項由Weill Cornell醫學(xué)院研究人員主導的研究發(fā)現,信使RNA上常見(jiàn)的一種微小化學(xué)修飾在細胞應對壓力時(shí)發(fā)揮了出乎意料的重要作用。這項發(fā)現有助于闡明細胞生物學(xué)的一個(gè)重要方面,并可能引發(fā)更廣泛的影響,因為這種信使RNA修飾(被稱(chēng)為m6A),正是干預某新興類(lèi)別異常細胞的目標。
信使RNA(mRNA)是攜帶遺傳指令以合成蛋白質(zhì)的分子,常常被標記上m6A,而這一化學(xué)修飾就像一個(gè)“處置標簽”。在正常情況下,這個(gè)標簽幫助分解這些信使RNA,從而保持應對壓力的蛋白質(zhì)在較低水平。細胞存活和其他應激反應的信使RNA通常含有比平均更高的m6A。
在最近發(fā)表于《Cell》期刊的研究中,研究人員揭示了這一過(guò)程的驚人細節。他們發(fā)現,m6A會(huì )在信使RNA被核糖體讀取時(shí)觸發(fā)其降解,核糖體是將mRNA中的指令轉化為特定蛋白質(zhì)的細胞機器。研究人員發(fā)現,核糖體不僅僅讀取mRNA,還會(huì )在分子上搜索m6A,并確保含有這種修飾的mRNA被定向降解。研究進(jìn)一步發(fā)現,當細胞受到壓力時(shí),這一降解過(guò)程會(huì )被暫停,允許應激反應的信使RNA積累并產(chǎn)生幫助細胞恢復的蛋白質(zhì)。
“這些發(fā)現回答了關(guān)于m6A的一些基本問(wèn)題,并將改變我們對其在細胞應激反應及其與其他生物學(xué)過(guò)程關(guān)系的看法,”該研究的資深作者、Weill Cornell醫學(xué)院藥理學(xué)系的Samie Jaffrey博士表示。
盡管早在1970年代就已知信使RNA上經(jīng)常含有m6A,但這一修飾在過(guò)去幾年才開(kāi)始受到廣泛關(guān)注,許多重要的問(wèn)題仍未得到解決。
“我們知道信使RNA上的m6A可以誘導其降解,但之前并不清楚m6A的強大降解作用是如何被調節以控制細胞生理的,”研究的第一作者、Weill Cornell醫學(xué)院藥理學(xué)講師Shino Murakami博士指出。
研究人員最初懷疑在細胞壓力期間會(huì )有特定的信號通路關(guān)閉m6A的降解作用。為尋找這一調控機制,研究人員查閱了一個(gè)公共數據庫,該數據庫記錄了細胞在接觸多種化學(xué)物質(zhì)和處理后mRNA水平的變化。結果發(fā)現,暴露于抑制核糖體的化合物的細胞中,含有m6A的信使RNA水平異常升高,而這些RNA通常的水平較低,這說(shuō)明核糖體在降解含m6A的mRNA中發(fā)揮了重要作用。
這一發(fā)現促使他們揭示了一系列意外的事件:他們發(fā)現當核糖體遇到信使RNA上的m6A時(shí),會(huì )基本停止讀取。正常細胞條件下,另一個(gè)核糖體可能在第一個(gè)核糖體未越過(guò)m6A時(shí)跟上,從而導致兩者發(fā)生碰撞。這些“意外”實(shí)際上是有意義的事件,吸引了讀取m6A的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)啟動(dòng)RNA的處置。通過(guò)這種方式,編碼m6A修飾信使RNA的應激反應蛋白質(zhì)在正常非應激條件下不會(huì )被合成。
另一方面,在細胞壓力期間,核糖體的活動(dòng)通常會(huì )減少,因此可用的核糖體數量較少,這導致含m6A的mRNA得以積累,并能夠轉化為應激反應蛋白。
“m6A通路通常幫助抑制細胞中的應激反應,但我們知道在細胞壓力期間必須有一個(gè)機制將其關(guān)閉,而核糖體正是這一機制的關(guān)鍵組成部分,” Jaffrey博士表示。
這一發(fā)現可能對相關(guān)研究領(lǐng)域產(chǎn)生影響。新興的抗m6A研究領(lǐng)域正在進(jìn)行試驗,這些研究通過(guò)抑制催化mRNA上m6A形成的METTL3酶來(lái)探索其應用。研究提出,或許這些研究能夠促進(jìn)應激反應蛋白的表達,而這些蛋白在某些情況下被認為能抑制特定細胞的增長(cháng)。
“我們的新發(fā)現為預測能夠對METTL3抑制劑做出反應的特定細胞類(lèi)型提供了策略,這可能幫助我們確定相應研究中最有潛力的目標,” Jaffrey博士總結道。
期刊:Cell
標題:m6A alters ribosome dynamics to initiate mRNA degradation