長(cháng)期以來(lái)被認為無(wú)功能的“垃圾”RNA片段,實(shí)際上在抑制特定信使RNA(mRNA)的生成中發(fā)揮關(guān)鍵作用,并可能協(xié)助細胞應對氧化應激。這項突破性研究由俄亥俄州立大學(xué)團隊完成,成果發(fā)表于2025年2月11日的《分子細胞》期刊。
研究聚焦于轉移RNA(tRNA)內含子——這類(lèi)短序列在tRNA執行蛋白質(zhì)組裝功能前會(huì )被剪切丟棄。然而,新證據表明,這些被釋放的游離內含子(研究團隊稱(chēng)為“fitRNAs”)能與mRNA的關(guān)鍵區域結合,導致后者降解,從而阻斷蛋白質(zhì)合成。在氧化應激條件下,某些fitRNAs表現出異常穩定性,暗示其可能參與細胞應激適應機制。
“細胞若視其為無(wú)用,為何會(huì )演化出六種以上不同的清除機制?這不合邏輯,”資深作者、分子遺傳學(xué)教授**安妮塔·霍珀(Anita Hopper)**表示,“過(guò)去五年,我們通過(guò)精巧的實(shí)驗設計,逐步揭示了這些‘垃圾’序列的功能。”
機制解析:從“垃圾”到“調控者”
tRNA通過(guò)與mRNA的互補配對確保氨基酸鏈正確組裝。研究以酵母為模型,發(fā)現部分剪切后的內含子序列與mRNA互補,提示其可能影響遺傳信息翻譯。團隊針對兩類(lèi)tRNA內含子家族展開(kāi)實(shí)驗,證實(shí)刪除或過(guò)量表達fitRNAs可分別導致目標mRNA水平上升或下降。
值得注意的是,fitRNAs的作用機制與微RNA(microRNA)類(lèi)似,但存在顯著(zhù)差異。微RNA需依賴(lài)Argonaute家族蛋白降解mRNA,而酵母中缺乏此類(lèi)蛋白,暗示fitRNAs通過(guò)全新途徑發(fā)揮作用。此外,fitRNAs結合位點(diǎn)位于mRNA的蛋白質(zhì)編碼區,而非傳統非編碼“種子”區域。
進(jìn)化謎題與功能啟示
“若內含子低效無(wú)用,為何從人類(lèi)到酵母的各類(lèi)生物中均保留它們?”共同作者、博士生保羅·辛諾波利(Paolo Sinopoli)提出。團隊發(fā)現,某類(lèi)fitRNA可靶向33種mRNA,其對應蛋白多與細胞分裂及增殖相關(guān)。
在氧化應激條件下,特定fitRNAs的豐度與穩定性顯著(zhù)提升?;翮晖茰y:“健康狀態(tài)下,這些內含子可能僅發(fā)揮微弱調控作用;但在應激時(shí),其穩定性可能成為細胞存續的關(guān)鍵。”后續研究將探索fitRNAs在熱應激、營(yíng)養匱乏等條件下的表現。
雜志:Molecular Cell
DOI:10.1016/j.molcel.2025.01.019