小核仁RNA（snoRNA）是一類(lèi)非編碼RNA分子，其在基因調控中的作用以及與某些疾病的關(guān)聯(lián)，近年來(lái)逐漸被人們所關(guān)注，例如腸道炎癥和結腸相關(guān)問(wèn)題等。羅蘭大學(xué)遺傳學(xué)系的魚(yú)類(lèi)遺傳研究團隊詳細研究了斑馬魚(yú)基因組中snoRNA的時(shí)序表達，并創(chuàng )建了一個(gè)在線(xiàn)數據庫（snoDanio），以便進(jìn)行互動(dòng)式可視化。

由Máté Varga博士領(lǐng)導的研究團隊首次創(chuàng )建了分析斑馬魚(yú)中小核仁RNA（snoRNA）表達的數據庫，這一物種如今已成為生物醫學(xué)研究的重要模型。

snoRNA的功能對核糖體中負責合成蛋白質(zhì)的分子進(jìn)行某些關(guān)鍵修飾至關(guān)重要。因此，snoRNA在不同組織中的表達差異，支持了這樣的理論：其“蛋白質(zhì)工廠(chǎng)”的確切功能在不同組織之間可能會(huì )有所不同。

這一點(diǎn)值得關(guān)注，因為近年來(lái)多項研究亦指出某些snoRNA的表達變化與嚴重的生物相關(guān)問(wèn)題有關(guān)。

這一研究最近發(fā)表于《NAR Genomics and Bioinformatics》期刊，研究揭示了67個(gè)先前未知的snoRNA，以及先前描述的斑馬魚(yú)特有snoRNA。此外，該研究還提供了snoRNA分子在發(fā)育過(guò)程中及不同成年動(dòng)物組織間的綜合表達分析。

圖片鏈接：https://www.eurekalert.org/multimedia/1065139

圖片信息：小核仁 RNA （snoRNA） 是非編碼 RNA 分子，其在基因調控中的作用及其與某些疾病的關(guān)聯(lián)直到最近才為人所知。羅蘭大學(xué)遺傳學(xué)系的魚(yú)類(lèi)遺傳學(xué)研究團隊詳細研究了 snoRNA 在斑馬魚(yú)（一種重要的遺傳模式生物）基因組中的時(shí)間表達，并且還創(chuàng )建了一個(gè)在線(xiàn)數據庫 （snoDanio） 用于它們的交互式可視化。

“這是第一次系統地繪制斑馬魚(yú)中整個(gè)snoRNA組，并且最終形成的數據庫是全球第三個(gè)特定于單一物種的收集，”該研究的首席作者、博士生Renáta Hamar表示。“我們的結果顯著(zhù)擴展了我們對這些重要調節分子的認識，而其在全球成千上萬(wàn)的研究團隊中，用于探索人類(lèi)相關(guān)問(wèn)題。”

研究團隊還利用獨特的生物信息學(xué)流程，創(chuàng )建了一個(gè)互動(dòng)數據庫“snoDanio”，以分享他們的成果，使其他研究人員能夠快速分析自己實(shí)驗中的snoRNA表達。

斑馬魚(yú)是研究人類(lèi)相關(guān)問(wèn)題的經(jīng)典模型生物，超過(guò)80%與這些問(wèn)題相關(guān)的人類(lèi)基因在斑馬魚(yú)基因組中都有相應基因。來(lái)自羅蘭大學(xué)魚(yú)類(lèi)遺傳研究團隊的最新成果及snoDanio數據庫，可能為創(chuàng )建更好的斑馬魚(yú)模型提供幫助，從而加強我們對某些復雜問(wèn)題的理解。

雜志：NAR Genomics and Bioinformatics

DOI：10.1093/nargab/lqaf013