注:以下所有樣本盡量新鮮!
1、動(dòng)物組織采集(樣本量盡量保證在綠豆大小,約200mg以上)
① 取材應在冰上進(jìn)行,取材后組織用生理鹽水沖洗干凈,去除血漬和污物,并剔除非研究所需的組織;
② 吸干水漬并切小塊,放入已標記的凍存管中,液氮速凍后,轉運至-80℃冰箱保存。
2、貼壁細胞RNA采集樣本(樣本量1*10^8以上)
RNA試劑盒法:
① 用微量移液器將細胞培養液吸除干凈,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌;
② 將PBS吸除干凈后,再加入1ml PBS,用細胞刮收集細胞,3000rpm離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉運至-80℃冰箱保存;
③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說(shuō)明書(shū)為準。提取樣本經(jīng)液氮速凍后轉運至-80℃冰箱保存。
Trizol法:
① 貼壁細胞培養或處理結束后,去除培養液;
② 每10c㎡培養面積加入1ml Trizol試劑;
③ 用1ml槍頭反復吹打,使Trizol與細胞充分接觸并消化;
④ 將上述溶液轉移到試管中,用一次性注射器(或者槍頭)反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,使溶液呈現清亮且不粘稠的狀態(tài);
⑤ 經(jīng)液氮速凍后轉運至-80℃冰箱保存。
3、懸浮細胞RNA采集(樣本量1*10^8以上)
RNA試劑盒法:
① 懸浮細胞培養或處理結束后,3000rpm,離心10min,去除培養液;
② 收集細胞后,加入1ml 4℃預冷PBS溶液,輕搖洗滌,3000rpm,離心10min,棄去上清液,收集細胞沉淀,液氮速凍后轉運至-80℃冰箱保存;
③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說(shuō)明書(shū)為準。提取樣本經(jīng)氮速凍后轉運至-80℃冰箱。
Trizol法:
① 懸浮細胞培養或處理結束后,離心收集細胞,去除培養液
② 保留的細胞用PBS快速洗一次,離心除去PBS;
③ 每1×10^6個(gè)細胞加1ml Trizol試劑,用一次性注射器進(jìn)行反復吹打直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,整個(gè)溶液呈清亮且不粘稠的狀態(tài);
④ 經(jīng)液氮速凍后轉運至-80℃冰箱保存。
4、血液樣本采集
全血樣本(以下方法步驟僅供參考)
哺乳動(dòng)物需要采集白細胞進(jìn)行后續實(shí)驗,(具體方法需參考各種分離液試劑說(shuō)明書(shū))
① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使血液與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立放置;
② 每1ml新鮮抗凝血中加入10ml紅細胞裂解液,輕輕吹打混勻,裂解4-5分鐘;
③ 加入20-30ml PBS、HBSS、生理鹽水或無(wú)血清培養液;
④ 2400rpm-2700rpm離心5分鐘,棄紅色上清;
⑤ 重復步驟③和步驟④,直至紅細胞裂解完全,收集細胞沉淀;
⑥ 每1×10^6個(gè)細胞加入1ml Trizol試劑,液氮速凍后,轉運至-80℃冰箱保存。
5、血清樣本采集(備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來(lái))
① 用無(wú)抗凝劑血清管收集全血樣本,預留一定空間便于血清分離,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;
② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管(RNasefree)中;
③ 將分裝好的血清轉運至-80℃冰箱保存。
6、血漿樣本采集(備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴增不出來(lái))
① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使之與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;
② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管中;
③ 將分裝好的血漿轉運至-80℃冰箱保存。
7、菌類(lèi)(1*10^8 CFU以上的菌體)
液體培養基:
① 挑取單菌落于50ml液體培養基中,適宜溫度培養過(guò)夜,并在對數生長(cháng)期進(jìn)行菌體采集;
② 培養好的菌液適量轉入合適的離心管中,高速離心收集菌體,棄去上層培養基,用封口膜封口后液氮速凍,轉運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸;
固體或半固體培養菌種收集:
① 涂布平板培養的微生物,在菌體生產(chǎn)最旺盛時(shí)期刮下,置于1.5或2.0ml的離心管中,迅速液氮速凍。
② -80℃冰箱保存,轉運至-80℃冰箱保存,大體積干冰運輸。
樣本準備注意事項:
① 小體積的昆蟲(chóng)類(lèi)組織,如寄生蜂、螨等,可考慮用RNA保護劑進(jìn)行樣本收集,RNA保護劑的使用參照試劑說(shuō)明書(shū);
② 所有直接接觸樣本的試劑、耗材等物品均需要處于無(wú)RNA酶(RNasefree)環(huán)境;
③ 肝素會(huì )影響下游建庫測序,EDTA不適用于部分成分分析及PCR實(shí)驗,采集血液樣本時(shí)需根據檢測需求慎重選擇抗凝劑;
④ RNA樣本提取可采用RNA試劑盒、Tirzol法等,注意RNA樣本的純化,避免多糖多酚、蛋白和其它雜質(zhì)的殘留。提取完成后,提供Nanodrop、AGE或Agilent 2100中一種或多種形式的分析結果以判斷RNA的完整性、濃度、總量是否滿(mǎn)足需求。寄送TotalRNA的需注明提取所用的方法,如試劑盒或Tirzol法等;
⑤ 樣本標簽勿粘貼在EP管或錫箔紙上,低溫下標簽紙易脫落,建議使用記號筆標記;
⑥ 細胞樣本不建議采用粘稠保護劑保存,否則將無(wú)法離心收集存放在保護劑的細胞樣本;
⑦ RNAlater、RNAstore等保護劑在25℃下能穩定保存樣本3天,4℃保存樣本7天、-20℃條件下可長(cháng)期保存樣本。建議用保護劑保存的樣本厚度不超過(guò)0.5cm。保護劑不適用于血液和液態(tài)樣本,組織樣本與保護劑的用量至少為1:10,RNAstore不適用于植物樣本保存。(不同保護劑保存時(shí)間有差異,具體以保護劑說(shuō)明書(shū)為準);
⑧ Trizol為裂解液,不適用于組織樣本的保存,細胞除外。當細胞存放在Trizol中需注明每管的細胞數量。
樣本寄送注意事項:
① 樣本需要使用干冰進(jìn)行寄送,干冰消耗量為4-5kg/天(根據溫度會(huì )有所變動(dòng)),訂購量以快遞實(shí)際運輸天數為準(避開(kāi)大型節假日及線(xiàn)上購物節)。干冰采用厚實(shí)的泡沫箱進(jìn)行打包,外側用透明膠封好;
② 樣本寄送我司時(shí)需填寫(xiě)《項目送樣單》。送樣單中樣本信息、數量、分組與編號需與實(shí)際保持一致,紙質(zhì)版送樣單隨樣本寄出,電子版送樣單及寄送快遞單號發(fā)送給公司,以便核對及備份數據;
③ 在我司完成測序分析后,剩余樣本需要返還的項目,需在收到項目完整版結題報告3個(gè)月內聯(lián)系我司進(jìn)行樣本返還,逾期樣本將進(jìn)行銷(xiāo)毀。如果樣本特別珍貴,需提前說(shuō)明。樣本返回需要送樣方承擔返還費用(包括干冰費和快遞費);
④ 為確保實(shí)驗的順利,送檢方需盡可能提供樣本,以防部分樣本降解重新取材、制備或送樣,耽誤檢測進(jìn)程。